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Genome-wide identification of non-coding RNAs in Komagatella pastoris str. GS115

  • Hugo Schneider
  • , Sebastian Bartschat
  • , Gero Doose
  • , Lucas Maciel
  • , Erick Pizani
  • , Marcelo Bassani
  • , Fernando Araripe Torres
  • , Sebastian Will
  • , Tainá Raiol
  • , Marcelo Brígido
  • , Maria Emília Walter
  • , Peter Stadler

Résultats de recherche: Le chapitre dans un livre, un rapport, une anthologie ou une collectionContribution à une conférenceRevue par des pairs

Résumé

The methylotrophic yeast Komagatella pastoris is a relevant bioengineering platform for protein synthesis. Even though non-coding RNAs are well known to be key players in the control of gene expression no comprehensive annotation of non-coding RNAs has been reported for this species. We combine here published RNA-seq data with a wide array of homology based annotation tools and de novo gene predictions to compile the non-coding RNAs in K. pastoris.

langue originaleAnglais
titreAdvances in Bioinformatics and Computational Biology - 9th Brazilian Symposium on Bioinformatics, BSB 2014, Proceedings
rédacteurs en chefSérgio Campos
EditeurSpringer Verlag
Pages115-122
Nombre de pages8
ISBN (Electronique)9783319124179
Les DOIs
étatPublié - 1 janv. 2014
Modification externeOui
Evénement9th Brazilian Symposium on Bioinformatics, BSB 2014 - Belo Horizonte, Brésil
Durée: 28 oct. 201430 oct. 2014

Série de publications

NomLecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics)
Volume8826
ISSN (imprimé)0302-9743
ISSN (Electronique)1611-3349

Une conférence

Une conférence9th Brazilian Symposium on Bioinformatics, BSB 2014
Pays/TerritoireBrésil
La villeBelo Horizonte
période28/10/1430/10/14

Empreinte digitale

Examiner les sujets de recherche de « Genome-wide identification of non-coding RNAs in Komagatella pastoris str. GS115 ». Ensemble, ils forment une empreinte digitale unique.

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