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VARNA: Interactive drawing and editing of the RNA secondary structure

  • INRIA Saclay, Laboratoire de Recherche en Informatique (LRI), Université Paris Sud
  • Université Paris-Saclay
  • INSERM U869

Résultats de recherche: Contribution à un journalArticleRevue par des pairs

Résumé

Description: VARNA is a tool for the automated drawing, visualization and annotation of the secondary structure of RNA, designed as a companion software for web servers and databases. Features: VARNA implements four drawing algorithms, supports input/ output using the classic formats dbn, ct, bpseq and RNAML and exports the drawing as five picture formats, either pixel-based (JPEG, PNG) or vector-based (SVG, EPS and XFIG). It also allows manual modification and structural annotation of the resulting drawing using either an interactive point and click approach, within a web server or through command-line arguments.

langue originaleAnglais
Pages (de - à)1974-1975
Nombre de pages2
journalBioinformatics
Volume25
Numéro de publication15
Les DOIs
étatPublié - 1 janv. 2009
Modification externeOui

Empreinte digitale

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